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人工异源四倍体鱼基因组被揭示
2022-09-21 生命科学学院  湖南师范大学新闻网

(供稿 生命科学学院)9月14日,我校刘少军院士团队在BMC Biology在线发表了题为“Symmetric subgenomes and balanced homoeolog expression stabilize the establishment of allopolyploidy in cyprinid fish”的论文。刘少军为该文通讯作者,我校任力副教授、高鑫博士、崔佳琳博士、张纯教授和北京百迈客生物科技有限公司戴鹤为该文共同第一作者。我校与北京百迈客生物科技有限公司等单位合作完成该文,相关研究得到国家自然科学基金和湖南省自然科学基金等项目的支持。

上世纪80年代,刘筠院士领衔科研团队以二倍体红鲫(Carassius auratusred var., 2n = 100)为母本、二倍体鲤(Cyprinus carpioL., 2n = 100)为父本,通过属间远缘杂交研制出两性可育的四倍体鲫鲤品系,目前该品系已培育到F29代。异源四倍体鲫鲤品系的建立打破了传统认识上的物种间生殖隔离,是国际上首次通过远缘杂交获得的脊椎动物四倍体品系。团队利用该四倍体鱼资源研制了优质三倍体鲫鱼(湘云鲫)和三倍体鲤鱼(湘云鲤),并在生产上得到了广泛应用。刘少军不但作为主要研究人员之一,积极参与了前期的研究工作,而且后续带领团队对该异源四倍体鱼品系进行了系统的维系和遗传改良,此外,他还带领团队研制出一系列新型可育二倍体和四倍体鱼品系。

该研究利用PacBio RS II测序技术长度长的优势,结合基因组单分子光学图谱和高通量染色体构象捕获技术(HI-C),构建了高质量的异源四倍体鲫鲤基因组(图1B),其基因组组装大小为2.95Gb,BUSCO评估基因完整度约96.4%。

远缘杂交形成可育品系过程中基因组结构特性和基因表达特性是非常值得系统研究的内容。对人工创制的异源四倍体鱼的基因组等生物学特性进行研究,在鱼类育种及探索鱼类演化规律等方面具有重要意义。

论文链接:https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01401-4

编辑:冯振辉

责编:马铁泉

审核:陈丽荣

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